Whatsapp posee una aplicación que permite administrarlo desde la pc, aparte de la versión web, lo puedes encontrar en
https://www.whatsapp.com/download
Una de las contras es que no funciona en sistemas operativos anteriores a windows 8 y solamente se puede administrar una cuenta.
Como alternativa, se puede emplear Altus que es una aplicación Electron, que habilita para usar whatsapp incluso en windows 7 y además permite administrar varias cuentas, en pestañas distintas.
Lo puedes encontrar en
https://github.com/amanharwara/altus
ACTUALIZACIÓN
Versiones actualizadas en el sitio del creador
Nueva versiones 2024
En las actualizaciones de github
https://github.com/amanharwara/altus/releases